Communication scientifique
Session of 2 février 2021

PCR et paléogénétique : pour le meilleur et pour le pire

MOTS-CLÉS : ADN ancien, Réaction de polymérisation en chaine en temps réel, Paléopathologie/méthodes, Contamination par de l’ADN
PCR and paleogenetics: for best and for worst
KEY-WORDS : Ancient DNA, Real-Time Polymerase Chain Reaction, Paleopathology/methods, DNA Contamination

E.-M. Geigl*

L’auteur déclare ne pas avoir de liens d’intérêts.

Résumé

Au milieu des années 1980, l’extraction et l’analyse de l’ADN préservé dans des vestiges biologiques du passé ont donné des premiers résultats, entérinant la naissance du domaine de la paléogénétique. C’est grâce à l’invention de la PCR que cette nouvelle discipline a pu évoluer et récolter ses premiers succès. Néanmoins, la nature dégradée de l’ADN ancien et la puissance de la méthode de la PCR ont aussi abouti à de nombreux artefacts dus à la contamination avec l’ADN moderne qui ont failli tuer ce nouveau domaine à la fin des années 1990. L’application de procédures expérimentales rigoureuses et le développement de méthodes de décontamination et de prévention des contaminations ont ensuite permis la renaissance de la paléogénétique avant que le séquençage massivement parallèle n’ait rendu possible l’obtention d’information génomique d’individus anciens et l’essor du domaine.

Summary

In the middle of the 1980s, extraction and analysis of DNA preserved in biological remains of the past yielded the first results, giving rise to a new scientific field, paleogenetics. Its first successes were obtained thanks to the advent of PCR. Yet, the degraded nature of ancient DNA and the power of PCR also led to numerous artefacts owing to contamination with modern DNA that have almost killed this new field at the end of the 1990s. Strict experimental procedures and the development of methods of decontamination and contamination prevention allowed the revival of the field. Recently, genome-wide analyses of ancient individuals through next-generation sequencing led to the unfolding of paleogenetics.

Cet article a été publié dans le Bulletin de l’Académie nationale de médecine sous la référence figurant ci-dessous. Il est disponible sur les plateformes en ligne de la revue :

Accès à l’article sur le site Science Direct : https://doi.org/10.1016/j.banm.2020.12.022 (Discussion)

Accès à l’article sur le site EM Consulte (Discussion)

*Université de Paris, CNRS, Institut Jacques-Monod, 15, rue Hélène-Brion, 75013 Paris, France

Bull Acad Natl Med 2021;205:389-95. Doi : 10.1016/j.banm.2020.12.022