annotation fonctionnelle du génome l.f.
functional annotation
Opération consistant à assigner des fonctions biologiques aux séquences d’un génome identifiées lors de son annotation structurale.
→ génomique fonctionnelle, annotation structurale du génome
[Q1]
Édit. 2019
annotation structurale du génome l.f.
structural annotation
Opération consistant en l’analyse de la séquence d’un génome, afin d’identifier et de localiser ses séquences remarquables (gènes, séquence régulatrices, etc).
L’annotation structurale exploite les homologies (ressemblances) entre des motifs d’ADN pour reconnaître des séquences conservées et donc potentiellement fonctionnelles. Cette analyse permet d’identifier des séquences codantes, des motifs régulateurs, des séquences répétées (transposons, microsatellites, minisatellites, virus intégrés dans le génome, etc).
Syn. annotation syntaxique
→ génomique structurale, génome, ADN, transposon, séquence codante
[Q1]
Édit. 2019
génome n.m.
genoma
Ensemble du matériel génétique, codant et non codant, d'une cellule, d'un virus ou d'un organite, c'est-à-dire du patrimoine chromosomique héréditaire.
Selon le mode de transmission du patrimoine génétique, le génome est qualifié d'haploïde, de diploïde ou de polyploïde, lorsqu'il y a une seule, deux ou plusieurs copies du chaque chromosome dans la cellule.
→ haploïde, diploïde, polyploïde
mobilisation d'un génome l.f.
genome mobilisation
Transfert complet ou partiel d'un génome d'une cellule à une autre par l'intermédiaire d'un plasmide conjugatif lors d'une conjugaison bactérienne.
1) Une partie du chromosome bactérien d'une cellule Hfr peut être transférée par un plasmide conjugatif à une cellule F : c'est la mobilisation chromosomique.
2) Un plasmide non conjugatif peut être transféré après co-intégration avec un plasmide conjugatif : c'est un cotransfert.
3) Un plasmide non conjugatif peut être transféré seul lorsqu'il utilise les liaisons intercellulaires créées par un plasmide conjugatif.
Étym. lat. mobilis : mobile, de movere : mouvoir : gr. genos : origine, naissance
→ plasmide F, plasmide conjugatif, plasmide non conjugatif, cotransfert
protéine gardienne du génome l.f. (désuet)
[C1]
Édit. 2017
zone de sécurité du génome l.f
genomic safe harbor (GSH)
Site du génome apte à intégrer un nouvel ADN qui sera fonctionnel et n’altèrera pas le génome hôte.
Les zones ainsi définies sont idéales pour y introduire des transgènes à application thérapeutique (thérapie génique). Leur identification et leur validation dans le génome humain sont en cours.
[Q1]
Édit. 2017
système mini-génome l.m.
mini-genome system
Transfection de cellules en culture avec un mélange de plasmides permettant l’expression des protéines virales et d’un ARN pseudo-viral porteur d’un gène rapporteur, la luciférase par exemple,
Ce système permet de reconstituer des pseudo-ribonucléides virales et d’évaluer ainsi l’activité de la polymérase virale en mesurant l’activité du gène rapporteur dans les lysats de cellules transfectées.
[D1]
Édit. 2020
angle de base l.m.
basic angle
Angle de déviation de loin, mesuré avec la correction optique totale par la méthode de l'écran alterné.
C'est donc l'angle mesuré en éliminant la fusion et l'accommodation.
[P2]
Édit. 2017
avulsion de la base du vitré l.f.
avulsion of the vitreous base
Arrachement localisé de la base du vitré, en général à la suite d’une contusion grave du globe oculaire.
Étym. lat. avulsio: enlèvement
base n.f.
base
En chimie, composé capable de se dissocier en libérant des anions OH-, et qui se combine avec les acides pour donner des sels et de l'eau.
Les bases fortes comme la soude ou la potasse sont totalement ionisées dans l'eau. L'ammoniaque, les amines, sont des bases moins fortes.
Édit. 2017
base de la cochlée l.f.
basis cochleae (TA)
base of cochlea
Extrémité élargie de la cochlée.
Elle répond au fond du méat acoustique interne.
Édit. 2017
base de la corne postérieure de la moelle spinale l.f.
basis cornu posterioris medullae spinalis (TA)
base of posterior horn of spinal cord, base of dorsal horn of spinal cord
Partie de la corne postérieure de la moelle spinale adjacente à la substance intermédiaire latérale.
Édit. 2017
base de la langue l.f.
base of the tongue
Édit. 2017
base de la mandibule l.f.
basis mandibulae (TA)
base of mandible
Partie inférieure du corps de la mandibule.
Édit. 2017
base de la patella l.f.
basis patellae (TA)
base of patella
Bord supérieur de la patella.
Syn. anc. base de la rotule
Édit. 2017
base de la prostate l.f.
basis prostatae (TA)
Partie supérieure de la postate
Elle répond à la vessie et aux vésicules séminales.
Édit. 2017
base de la rotule l.f.
Édit. 2017
base de l'os métacarpien l.f.
basis ossis metacarpi (TA)
base of metacarpal
Extrémité proximale de l’os métacarpien.
Elle s’articule avec les os de la deuxième rangée du carpe et avec les métacarpiens voisins sauf le premier.
Édit. 2017
base de l'os métatarsien l.f.
basis ossis metatarsi (TA)
base of metatarsal
Extrémité postérieure de l’os métatarsien.
Elle s’articule en arrière avec les os du tarse et latéralement avec les métatarsiens voisins.
Édit. 2017
base de l'os sacrum l.f.
basis ossis sacri (TA)
base of sacrum
Partie supérieure du sacrum.
Elle correspond à la face supérieure de la première vertèbre sacrale.
Édit. 2017
base de l'utérus l.f.
Édit. 2017
base de Schiff l.f.
Schiff base
Double liaison C=N réunissant un carbone appartenant à une molécule donnée à un azote appartenant à une autre molécule.
Des bases de Schiff existent dans de nombreux complexes entre petite molécule et protéine, lipide ou acide nucléique, par exemple entre un glucose et un résidu de lysine de l’hémoglobine pour donner l’hémoglobine glyquée A1c (glycation) ou entre un dérivé carbonylé et la lysine , la cystéine ou l’histidine d’une protéine pour donner une protéine carbonylée.
H. Schiff, chimiste italien (1866)
→ glycation, carbonylation, hémoglobine glyquée A1c
[C1]
Édit. 2017
base des phalanges de la main l.f.
basis phalangis manus (TA)
base of phalanx of hand
Extrémité proximale renflée de chaque phalange.
Dans les phalanges proximales elle présente une cavité glénoïde pour la tête du métacarpien avec lequel elle s’articule, deux facettes palmaires pour les sésamoïdes et deux tubercules latéraux sur lesquels, pour les quatre derniers doigts s’insèrent les ligaments latéraux de l’articulation métacarpo-phalangienne. Pour les deuxième et troisième phalanges elle présente une surface articulaire à deux facettes concaves séparées par une crête mousse qui s’articule avec la trochlée de la tête de la phalange qui lui est proximale.
Édit. 2017
base des phalanges du pied l.f.
basis phalangis pedis (TA)
base of phalanx of foot
Extrémité proximale renflée de chaque phalange.
Dans les phalanges proximales elle présente une cavité glénoïde pour la tête du métatarsien avec lequel elle s’articule, deux facettes palmaires pour les sésamoïdes et deux tubercules latéraux sur lesquels, pour les quatre derniers orteils s’insèrent les ligaments latéraux de l’articulation métatarso-phalangienne. Pour les deux phalanges distales, elle présente une surface articulaire à deux facettes concaves séparées par une crête mousse qui s’articule avec la trochlée de la tête de la phalange qui lui est postérieure.
Édit. 2017
base du cartilage aryténoïde l.f.
basis cartilaginis arytenoideae (TA)
base of aryteneoide cartilage
Partie inférieure élargie du cartilage aryténoïde.
Édit. 2017